扬州市第三人民医院始建于1975年，2008年经市政府批准，医院整体搬迁于现址扬州市邗江区杨庙镇苍颉路2号，目前医院占地面积7.7万平方米 、建筑总面积4.5万平方米，编制床位500张，实际开放356张。现有职工338名，其中高级职称人员84名，硕士研究生15名。是中国公共卫生医院联盟单位、上海市公共卫生临床中心结核病防治和结核外科扬州联合协作中心、扬州大学医学院临床教学医院、扬州市耐多药肺结核病定点收治医院。是集医疗、科研、教学、预防为一体的三级乙等专科医院。
医院拥有感染病科、肝病科、肺结核科、医学影像科、医学检验科、呼吸内科六个扬州市临床重点专科，其中肺结核科为省级重点专科培育单位。开设了综合内科、综合外科（普外科和骨科）、肝病科、肺结核科、感染病科、急诊医学科、皮肤科、中医科及高血压病、糖尿病、脂肪肝、狂犬病暴露预防处置等专科专病门诊。
医院拥有高端螺旋CT、1.5T核磁共振成像设备、DSA、DR、高端彩色超声多普勒诊断设备、胸腔镜、腹腔镜、骨关节镜、支气管内窥镜系统、肺功能检测设备、ECMO、IABP主动脉内球囊反博器、全自动生化免疫分析系统、人工肝支持系统等先进医学装备120余台套。
医院秉承“以人为本、与时俱进”的办院理念，坚持“精专科、强综合”的发展思路，积极应对突发公共卫生事件，勇担社会责任，不断提升医院整体综合服务能力。医院先后获得“全省抗击新冠肺炎疫情先进集体”、“全省五一劳动奖章”、“创建全国文明城市先进单位”、“江苏省公共机构节能示范单位”、“扬州市文明单位”等荣誉称号。
根据扬州市人民政府关于健全重大疫情防控体制机制、提升公共卫生应急处置能力的意见，推进传染病专科医院建设，医院将要增挂扬州市公共卫生临床中心的牌子，启动实施美狮贵宾厅的扩建项目，未来一个环境更加优美、布局更加合理、功能更加齐全的新三院将屹立在美丽的扬州西区。
